下位条鰭類は 4 つの主要系列 (ポリプテルス類，チョウザメ類，ガーパイク類，アミア) からなり「古代魚」と呼ばれます．私たちはミトコンドリアゲノムデータを用いて，これらの魚類に真骨類を含めた条鰭類の高次系統関係を検証し，これまで提唱されている仮説と比較しました．

ベイズ法，最尤法，最節約法を用いて解析を行ったところ，3つの解析で同じ樹形が統計的に高い値で支持されました．ミトコンドリアゲノムデータは真骨類 (アロワナ類とこれより派生的なグループ) が単系統であることを示しただけでなく，古代魚の 3 系統 (チョウザメ類，ガーパイク類，アミア) が一つのグループとなり真骨類の姉妹群となることを示唆しました．

古代魚 3 系統が単系統となる関係はこれまで形態データを中心とした解析では提唱されたことがありませんでしたが，核 DNA マーカーに基づく仮説と一致していました．