MIDORI

2023 年 3 月 19 日 改訂

MIDORI は、ミトコンドリアゲノムにコードされている 15 遺伝子配列のリファレンス・データベースです。真核生物の配列で構成されています。動物だけでなく、菌類、緑藻類、陸上植物、現生生物が含まれます。GenBank NT データベースを元に作成され、データ名には分類情報が付加されています。環境 DNA 解析用です (Leray et al, 2022)。

Web ツールはこちら (Larey et al 2018). Email: 欄に Emal アドレスを記述しないと、解析が終わらない模様。

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複数の fasta file を一つをまとめるスクリプト

eDNA scripts > 「fasta: MIDORI から phyloSCOPE format へ」を参照。